Étude de faisabilité.
Nous sommes biodesigners de protéines
Chaque nouvelle protéine est un cas spécifique et un nouveau défi passionnant pour notre équipe. Pour réussir, le projet de production de protéines doit être bien conçu dès le départ. Pour maximiser nos chances de vous donner entière satisfaction en nous confiant votre protéine d’intérêt, nous allons passer par différentes étapes décrites ci-après.
Étude de faisabilité : les principales étapes
1/ Discussion de votre projet et des attentes
2/ Étude préliminaire et devis
3/ Option - Ingénierie in silico
4/ Réalisation du/des vecteur(s) d'expression
5/ Criblages des conditions d'expression et de purification
6/ Rapport et faisabilité et envoi d'échantillon(s)
Discussion de votre projet et de vos attentes
Dès que vous nous aurez fait part de votre demande, nous vous proposerons un premier échange téléphonique ou par visioconférence, afin de discuter de votre projet pour bien comprendre vos besoins et vos objectifs. Un accord de confidentialité pourra être mis en place si besoin à ce stade.
Étude préliminaire et établissement d’un devis
Etude bibliographique et analyse de séquence
À partir des informations que vous nous aurez fournies, nous allons rechercher dans la littérature et/ou analyser les articles que vous nous aurez transmis, afin d’identifier les conditions préalables et le système fonctionnant le mieux pour exprimer votre protéine d’intérêt. Nous allons ainsi rassembler toutes les conditions ayant un impact positif sur l’expression de la protéine mais aussi détecter toute difficulté potentielle que nous pourrions rencontrer.
En utilisant les bases de données sur les protéines et nos outils d’analyse des séquences, nous établirons, sur la base de cette étude préliminaire, un plan de travail et un devis afin d’évaluer rapidement et efficacement notre capacité à produire votre protéine d’intérêt.
En option : ingénierie protéique in silico
Grâce à notre partenariat avec des sociétés d’intelligence artificielle qui ont développé des solutions propriétaires pour prédire les caractéristiques des protéines in-silico, nous pouvons générer très rapidement et efficacement une bibliothèque de mutants qui auront la propriété spécifique ou optimisée que vous recherchez pour votre produit ou réactif : stabilité accrue, activité améliorée, affinité plus forte, meilleure spécificité…
Conception et réalisation du vecteur d’expression
La conception de la construction ADN est également une étape critique où l’expérience d’un spécialiste fait la différence et augmente les chances de succès d’un projet de production de protéines.
Ainsi, le bon choix de l’étiquette (tag) d’expression (6xHis, Avi, Strep…), son positionnement par rapport au gène, la taille de la séquence entre l’étiquette et la région codante, la sélection du promoteur… sont autant de facteurs influençant le niveau d’expression, la purification et le bon repliement de la protéine.
Forts de notre expertise de plus de 11 années en production de protéines et de nos partenaires spécialistes en biologie moléculaire, nous saurons vous recommander la ou les construction(s) ADN qui permettra (-ont) d’exprimer et purifier votre protéine d’intérêt de manière optimale.
Criblage des conditions d’expression
Dès que nous aurons une construction ADN prête à l’emploi, nous testerons les différents paramètres clés pour chaque système d’expression utilisé :
– concentration en sels, type d’extrait cellulaire, T°C… pour le système de synthèse protéique sans cellules (CFPS)
– T°C, milieu, clones… pour les systèmes basés sur E. coli
La combinaison de paramètres donnant le meilleur niveau d’expression et une protéine entière, soluble le cas échéant, sera à cette étape, sélectionnée par analyse Western Blot.
– Estimation du rendement de l’expression
Lorsque les meilleures conditions d’expression sont définies, une production à petite échelle est réalisée pour permettre le développement du protocole de purification et estimer le rendement de production de la protéine. Le produit purifié obtenu est ensuite soit expédié au client pour être testé, soit utilisé dans le cadre des tests de contrôle de la qualité effectués à Synthelis.
Retrouvez nos services sur :
Nous attendons
vos questions
avec impatience
La biotech
qui murmure
aux oreilles
des protéines.
Cell-Free Systems Applications